1949年以來，黨和政府十分重視民族醫藥工作。組織大量的人力、物力，對蒙藥的發掘、收集整理、資源普查與開發利用、新藥的研制等方面做了大量的工作。在醫療、科研、教學、藥材的產、供、銷等諸方面均取得了可喜的成績。

　　據有關文獻統計，目前較為常用的1342種蒙藥中，常用品種約450種。其中植物藥占313種，動物藥占66種，礦物藥48種，其他23種。這些藥物中有些是動植物的全體，如方海、扁蕾、香青蘭；有些只是動植物體的一部分，如狐肺、草烏葉；也有些是動植物分泌或滲出的物質，如牛乳、珊瑚、黑云香；有些是經過加工制得的物質，如灰鹽（草木灰水浸汁經過濾蒸發所得結晶物），馬奶酒（鮮馬奶經過發酵而釀成）；礦物藥中有些是天然礦石，如禹糧土（一種含鐵粘土）、青金石等軸晶系（Na，Ca）8［AISiO4］6（SO4，CI，S）2或如紅銅炭之類的加工品，有的則是諸如龍骨、石燕等動物骨化石。

　　在眾多的蒙藥中有不少種藥材是蒙藥專用品種（即只有蒙醫習慣使用的藥物），在常用蒙藥中約有140種。如：廣棗，蒙醫用于心悸、心絞痛心臟病。沙棘，蒙醫用來止咳去痰，活血化瘀。藍盆花，蒙醫用于清肺熱和治療肝熱病。文冠木，蒙醫用于清熱燥濕，治療風濕、痹癥。現代有關科學研究都證實了它們的藥效確切，療效可靠。這此藥物中醫從來就不用。

      還有許多藥材蒙醫用，中醫也用，這類藥材習稱中蒙藥交叉品種。在常用蒙藥中約有180種。這些藥材雖然中醫和蒙藥都用，但是由于各自理論體系不同，實踐經驗有別，因此，對這些藥物的認識和應用也就必然有所差異。以訶子為例：訶子，蒙醫視為眾藥之王，廣泛應用。認為“訶子具咸外五味”（清·伊希巴拉珠爾《認藥白晶藥鑒》），“為治諸病之上品”（清·羅布桑卻配勒《蒙醫藥選編》），主治“三邪”諸癥，血癥，黃水癥以及解毒，調中，補益。因此，臨床各科配方常不可少之。如清·吉格木德丹金扎木蘇的《蒙醫傳統驗方》316方中，含有訶子的藥方占一半多，足見訶子是蒙藥中的最常用品種。而中醫則一般以其澀腸止瀉，斂肺和咽，在其他方面用得很少。

　　有些蒙藥與中藥雖然來源于同種植物，但是取用部位不盡相同。如：達烏里龍膽，蒙藥用其花（小秦艽花），中藥則用其根作秦艽用，石榴，蒙藥用其果實或種子，中藥則用果皮。上邊談到的廣棗，蒙藥用它的果實，中醫偶有用其樹皮治燙傷。草烏，中藥僅用它的塊根，蒙藥不但用其塊根，還分別用草烏芽、草烏花.真可謂對草烏資源的充分利用。蒙藥品種從總體上有著上述特點外，還具有一定的地域特點，與地理、資源條件相適應。如廣棗、三七、木香、山柰、姜黃、馬錢子、胡椒、益智仁、肉桂、沉香等蒙藥材生長在長江以南地域，具有熱帶、暖溫帶特點的藥材在蒙藥中占一定的比例，蒙醫習稱其為南藥，在常用蒙藥中約有110種。人參、北沙參、苦參、甘草、草烏、百合、沙棘、文冠木、多葉棘豆、狼毒、肉蓯蓉等蒙藥材生長在長江以北，蒙醫習稱其為北藥，在常用蒙藥中約有220余種。

　　地理環境上，如船形烏頭、唐古特烏頭、金腰草、烏奴龍膽、胡黃連、白花龍膽、囊距翠雀花、喜馬拉雅紫茉莉、烈香杜鵑等生長在青藏高原，且為藏醫習用藥材，從《月王藥診》中有其記載，沿用一千余年不衰。隨著《四部醫典》傳入蒙古地區，藏藥對蒙藥的發展起了一定的促進作用，同時部分藏藥亦被蒙醫收用，因此，還有許多藥物蒙醫和藏醫同樣用，這類藥物習稱蒙藏交叉品種。在常用蒙藥中，象這類藥材約有35種。此外象沙棘、多葉棘豆、硬毛棘豆、香青蘭、蒙古山蘿卜花、黃花黃芩、冷蒿等有著蒙古高原特點的地產藥材為蒙藥的主體。其中甘草、蒙古黃芪、麻黃、肉蓯蓉等又是內蒙古的特產，并聞名國內外。　

      據不完全統計，目前在內蒙古供、銷的商品藥材中，地產的藥材約有80余種，其中蒙醫所用藥材占70余種。另外全區各地蒙醫自采自用的藥材亦有60余中。 蒙藥種類繁多，資源豐富，且以植物藥為主。據文獻記載，內蒙古分布的種子植物和蕨類植物共計2351種，其中引種栽培的植物有184種，野生植物共2176種，分屬于133科720屬；野生藥用植物1122種，分屬117科1033種。此外藥用藻類1科2種，菌類24科68種，地衣5科7種，苔蘚11科12種。其中常用藥為104種，最常用藥78種，占全國最常用植物藥的36％。

　　蒙醫常用藥有450余種，蒙醫專用260余種，本區自產藥材占30％。以清熱藥、祛巴達干藥、抑赫依藥、祛黃水藥物為主。還有驅蟲藥、促使熱疾成型的藥物、殺粘藥、利尿逐水益腎藥、破痞去滯藥、止咳化痰藥、瀉下藥、止瀉藥、滋補強壯藥等17類。

　　蒙藥中有許多具開發利用價值的資源。如無患子科植物文冠果莖枝，是蒙醫專用藥。經過化學分析，鄧麗嘉予試其含有黃酮類、皂甙、揮發油、油脂、香豆素、甾醇及糖類，顧維彰等對不同產地的文冠木的成分對比分析，并從文冠木中得到兩種黃酮，即楊梅樹皮素與雙氫槲皮素。黃雅芳等從其乙醇提取物中分離到5種化合物，即雙氫槲取素、雙氫楊梅樹皮素、表兒茶粉、表沒食子兒茶精和一種結構未知的化合物。毛莨科植物北草烏的干燥葉，顧維彰等從其中分離得烏頭堿、次烏頭堿、新烏頭堿、去氧烏頭堿及北草烏堿。漆樹科植物南酸棗的干燥成熟果實中，鄧麗嘉等從其中得到黃酮、有機酸、甾醇、揮發油、香豆素、糖和酚性成分。木犀科植物賀蘭山丁香的根中。周長風等經予試得到揮發油。油脂、甾體、萜體、酚性成分、蒽醌、香豆素、氨基酸、蛋白質及糖類。菊科植物萵苣的種子，鄧麗嘉等從其中得揮發油、黃酮類、氨基酸、肽蛋白質、酚性成分及糖類。漏蘆的花，經顧維彰等分析，花中含有揮發油、黃酮類、植物甾醇、三萜類及糖類等。劉國聲報道內蒙古紫草含B、B－二甲基丙烯酰紫草素為1．21％，含量高于紫草等等。又如：廣棗（珠如很芍沙），具有清心火，強心之功效；經其藥理分析，具有治療冠心病、心律失常之作用。蒙古山蘿卜花（胡和�烏達巴拉），具清熱之功效，經藥理研究具有顯著強心作用。山沉香（阿拉善阿嘎如），具抑赫依、清熱、止痛、利呼吸之功效；經現代藥理研究具有一定的抗驚厥作用，對中樞神經有明顯的抑制作用，并有顯著的鎮痛作用。蓽茇（必必靈）有調理胃火、祛巴達干赫依、調節體素、滋補強壯、平喘、祛痰、止痛功效；經動物實驗，其揮發油具有耐缺氧和保護實驗性急性心肌缺血作用。白苣勝其揮發油有顯著的利尿作用，其總黃酮對心血管方面有良好的作用。文冠木（僧登）具有清熱消腫、止痛之功效。經研究其總黃酮具有顯著的鎮痛與抗炎作用。另外還有白龍菖菜、芯芭、小檗、紫花高烏頭、金蓮花等。這些資源具有一定的開發利用價值。其中部分資源已開發或正在開發利用。